Страница публикации

Алгоритм построения сетей взаимодействия видов в сообществах на основе результатов мониторинговых экологических исследований

Авторы: Букин Ю.С., Михайлов И.С., Черкашин Е.А.

Журнал: Докл. VII Междунар. конф. "Математическая биология и биоинформатика" (Пущино, 14-19 октября 2018 г.)

Том:

Номер:

Год: 2018

Отчётный год: 2018

Издательство: ИПМ им. М.В. Келдыша РАН

Местоположение издательства: Москва

URL:

Проекты:

DOI: 10.17537/icmbb18.24

Аннотация: Внедрение новых методов мониторинга биологического разнообразия экосистем и сообществ, включающие в себя методы метабаркодинга на основе расшифрованных последовательностей ДНК определенных генетических маркеров, значительно расширили потоки информации о спектрах видов и видовом разнообразии. Во многих случаях, особенно при исследовании сообществ микроорганизмов неизвестно, какие виды взаимодействуют друг с другом, и это взаимодействие носит взаимно положительный или отрицательный характер. В работе мы предлагаем алгоритм, который на основе корреляционного анализа, при достаточно больших выборках информации мониторинговых исследований экосистем, позволяет построить сеть взаимодействия между организмами. В сети отражается информация о том, между какими видами в сообществе существует взаимосвязь, и каков характер этой связи, положительный или отрицательный. Алгоритм реализован на языке программирования R.

Индексируется WOS: Нет

Индексируется Scopus: Нет

Индексируется УБС: Нет

Индексируется РИНЦ: Да

Индексируется ВАК: Нет

Индексируется CORE: Нет

Публикация в печати: 0