Страница публикации

Информационная инфраструктура для поддержки исследований микробиома Байкала

Авторы: Черкашин Е.А., Шигаров А.О., Христюк В.В.

Журнал: Информационные и математические технологии в науке и управлении

Том:

Номер: 4 (20)

Год: 2020

Отчётный год: 2020

Издательство:

Местоположение издательства:

URL:

Проекты:

DOI: 10.38028/ESI.2020.20.4.010

Аннотация: Рассмотрена проблема построения исследовательской среды для обработки данных секвенирования нового поколения (NGS - Next Generation Sequencing). Среда включает облачное хранилище данных (DaaS) и вычислительные службы (SaaS и PaaS), а также службы визуализации и интеграции данных. Осуществляется интеграция технологий с открытым исходным кодом для поддержки MiSeq SOP (стандартная операционная процедура), которая позволяет специалистам в предметной области - биологам независимо от программистов самостоятельно обрабатывать данные. Для реализации интеграции конструируются формальные модели SOP, позволяющие автоматически порождать исходный код компонентов среды. Технология преобразования основана на принципах архитектуры, управляемой моделями (Model driven architecture), и логическом выводе структур производных моделей и модулей. Представлены текущие результаты и задачи на ближайшую перспективу.

Индексируется WOS: Нет

Индексируется Scopus: Нет

Индексируется УБС: Нет

Индексируется РИНЦ: Да

Индексируется ВАК: Нет

Индексируется CORE: Нет

Публикация в печати: 0